in teoria doveva essere banale e invece non lo è..
dentro LR ho rinominato una cartella, ora succede che tutte le foto presentano il punto interrogativo, se provo a risincronizzare la cartella mi dice che quella foto già esiste con quel nome e non lo aggiorna, che posso fare?

Ma era una cartella di sistema? ovvero una del software di LR?

Hai provato a rinomarla col vecchio nome?. Prova a reinstallare LR3 e caomai anche il database se ce l'hai. (io per esempio uso LR3 solo per sviluppo e poi una volta esportate le foto, cancello le importazioni.)

cartella di foto
comunque risolto.. "trova file mancanti" solo che non m'aveva funzionato prima.. bò!