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No, non è possbile, ma non ne vedo l'utilità.
il NEF è il formato grezzo dei dati di una immagine,m che poi sarà resa visibile da un programma di sviluppo che ne interpreterà alcuni dati e ne modificherà tanti altri, senza andare ad intaccare i dati originali (quindi una operazione al 100% reversibile)

Se unisci due foto (fotomerge) ne ottieni una terza. Che senso avrebbe conservare i dati grezzi? se devi fare un quadro panoramico, sviluppi il nef al meglio, unisci le foto e le salvi in TIF, che è un formato senza perdita.

Se proprio ti piace camera raw, puoi sempre aprire il tif in camera raw, conservando gli stessi comandi, ma che non opereranno più sugli algoritmi di sviluppo, ma su quelli di modifica dei parametri del file.